José Amado Mendes é natural do concelho de Coimbra. Licenciou-se em História, pela Universidade de Coimbra (1972). Em 1974 concluiu o Master’s Degree in Sciences of Education, na Universidade do Texas, em Austin (EUA). Doutorado em História Moderna e Contemporânea pela Universidade de Coimbra (1985), onde obteve o título de agregado (1991) e foi professor catedrático.

Exerceu funções de gestão na Faculdade, inclusive como Presidente do Conselho Científico. Criou e coordenou os Cursos de Mestrado em História Económica e Social e de Museologia e Património e orientou várias dissertações de Mestrado e teses de Doutoramento.

Colaborou com o Polo de Viseu da Universidade Católica e é membro de associações científicas, nacionais e estrangeiras.

É professor catedrático da Faculdade de Letras da Universidade de Coimbra (ap.º) e da Universidade Autónoma de Lisboa, na qual coordena o Gabinete de Apoio a Mestrados e Doutoramentos e participa noutras atividades, letivas e de investigação.

Tem várias obras publicadas, nas áreas de: História Económica e Social, Historiografia, História Empresarial, Museologia e Património Cultural.